深圳港澳通行证办理程序：1、申请人到受理窗口咨询、领取并填写《中国公民因私赴港澳地区申请表》；2、数码照相，根据证件制作的要求，由申请人本人到受理机关或者公安局指定的数码照相点拍照；3、到受理窗口取号排队；4、申请人到受理窗口交验材料并领取《回执单》，可以选择邮政快递；5、申请人到办理窗口凭《回执单》打印缴费收据；6、申请人凭缴费收据到银行缴费；7、申请人凭银行收费单据和《回执单》到受理窗口领证。