不去皮吃比较好。
1.南瓜去籽去皮后，膳食纤维的含量并不高。
2.南瓜本身是属于高血糖生成指数的食物(比西瓜、小米、土豆等都要高)，尤其煮小(大)米南瓜粥等的时候，会导致血糖升高德较快。
3.皮中的膳食纤维对于延缓血糖上升具有至关重要的作用。
4.南瓜皮具有补中益气，消炎止痛，解毒杀虫，降糖止渴的功效； 主治久病气虚、脾胃虚弱、气短倦怠、便溏、糖尿病、蛔虫等病症。
5.南瓜皮并不会影响食用的口感。
功效：
1.南瓜子有很好的杀灭人体内寄生虫（如蛲虫、钩虫等）的作用；
2.对血吸虫也具有很好的杀灭作用，是血吸虫病的首选食疗之品；
3.南瓜子富含脂肪酸，可使前列腺保持良好功能；
4.所含的活性成分可消除前列腺炎初期的肿胀，同时还有预防前列腺癌的作用；
5.南瓜子含有丰富的泛酸，这种物质可以缓解静止性心绞痛，并有降压的作用；
6.经常吃南瓜子不但可预防肾结石的发生，还可促进已有结石的排出；
7.每天坚持吃少量南瓜子，可防治前列腺肥大。