南京有研究生点的大学有以下几所：第一梯队：南京大学，东南大学。

第二梯队：南京航空航天大学，南京理工大学，南京工业大学，南京邮电大学，河海大学，南京林业大学，南京信息工程大学，南京农业大学，南京医科大学，南京中医药大学，中国药科大学。

第三梯队：南京师范大学，南京财经大学，解放军理工大学。

文科理科最强的是南京大学，工科最强的是东南大学，整体实力第一梯队是南京大学和东南大学，第二梯队有南航、南理工、南农、河海、南师大、南医、中国药科大学，其他为第三梯队。