袁崇焕因为行事作风的问题，曾经让器重他的孙承宗大为震怒，擒杀毛文龙也是袁崇焕擅自主张，他的同事王在晋认为袁崇焕虽然死于国法，但是他的功劳不可淹没，但同时他也认为袁崇焕的死是自取灭亡。
袁崇焕，字元素，生于广东东莞石碣，祖籍广西梧州，于万历四十七年中进士，后通过自荐的方式在辽东边关任职，得到孙承宗的器重镇守宁远，在抗击清军的战争中先后取得宁远大捷、宁锦大捷，但因为不得魏忠贤欢心辞官回乡。
袁崇焕的军队是正义之师，并且训练有素，武器先进。
后金进攻宁远的战争是掠夺土地人民、争夺统治权力的不义战争，因而遭到辽东汉民的强烈反对，尤其是努尔哈赤对辽沈地区汉民的错误政策，引起后金与明朝两方面辖区汉民的不满和恐惧，从而促使宁远军民拼死抵御后金军的进犯，西洋大炮是袁崇焕获胜与努尔哈赤失败的一个基本因素，后金兵没有大的野战，兵无斗志、器械不利，明朝袁崇焕却在积极备战、修筑坚城、整械备炮、训练士马，所以袁崇焕会取得胜利。
袁崇焕的死主要是两个方面的原因，第一个是他卷进了党争，魏忠贤余党、毛文龙旧部以杀了毛文龙、与清延议和、市米资敌等罪名弹劾他，第二个是功高镇主，他在关宁军中的威望对一个皇帝而言着实有些可怕，第三个就是崇祯性格着实多疑刻薄，第四个原因就是，清军奇袭包围了京城，而袁崇焕必然要为此事负责，这四方面的原因叠加在一起。
袁崇焕案前前后后拖了七八个月，拖到最后也没有拿出什么确凿而又令人信服的证据，再加上有不少朝臣为他奔走喊冤，甚至还有愿意代他而死的，到这一点，冤死无疑。
此外还有一个趣闻，本来处理此案的兵部尚书梁延栋，是要将袁崇焕满门抄斩的，余大成去见梁说：“袁罪何来？岂非敌袭围京？吾视尚书反复六任也，坐兵部者全身而退者未有一人，今袁无能，令处夷刑，后敌又围京，先顾公之三族。
”梁延栋大约是被吓到了，于是便和温体仁一起给袁崇焕减了刑责，不至于祸至三族。