1.原核生物基因组很小，一般只有一条染色体；而真核生物基因组结构庞大。
2.原核DNA分子的绝大部分是用来编码蛋白质的，只有非常小的一部分不转录，这与真核DNA的冗余现象不同。
3.原核生物DNA序列中功能相关的RNA和蛋白质基因，往往集中在基因组的一个或几个特定部位，形成功能单位或转录单位，它们可被一起转录为还有多个mRNA的分子，叫多顺反子mRNA，而真核生物中没有这种结构，只有单顺反子。
4.原核生物基因组中有重叠基因。
5.真核生物基因组含有大量重复序列。
6.真核生物基因不连续，有内含子、外显子，原核生物则没有。
1、原核生物基因组很小，一般只有一条染色体；而真核生物基因组结构庞大。
2、原核DNA分子的绝大部分是用来编码蛋白质的，只有非常小的一部分不转录，这与真核DNA的冗余现象不同。
3、原核生物DNA序列中功能相关的RNA和蛋白质基因，往往丛集在基因组的一个或几个特定部位，形成功能单位或转录单位，它们可被一起转录为还有多个mRNA的分子，叫多顺反子mRNA，而真核生物中没有这种结构，只有单顺反子。
4、原核生物基因组中还有重叠基因。
5、真核生物基因组含有大量重复序列。
6、真核生物基因不连续，有内含子、外显子；原核生物则没有。
原核细胞和真核细胞的统一性表现在：
1.原核细胞具有与真核细胞相似的细胞膜和细胞质；
2.原核细胞与真核细胞均有DNA。
DNA与细胞的遗传和代谢关系十分紧密。
原核细胞是组成原核生物的细胞。
这类细胞主要特征是没有以核膜为界的细胞核，也没有核仁，只有拟核，进化地位较低。
真核细胞指含有真核，即被核膜包围的核的细胞。
其染色体数在一个以上，能进行有丝分裂，还能进行原生质流动和变形运动，而光合作用和氧化磷酸化作用则分别由叶绿体和线粒体进行。
除细菌和蓝藻植物的细胞以外，所有的动物细胞以及植物细胞都属于真核细胞 。
由真核细胞构成的生物称为真核生物。