南京被子在潮湿环境下容易发霉，特别是在长时间存放后。南京被子常用的填充物是棉花，除了温暖和柔软外，也较易吸湿，所以要注意存放时保持干燥。如果南京被子已经发霉，应先将其放置在阳光下适当晾晒，然后再用被芯清洗剂清洗。洗涤后，彻底晾干后才能再放回到床上使用。

尤其在梅雨季节、冬季潮湿比较大的时候，更要注意南京被子的保养，以免长时间存放导致发霉。