聚丙烯酰胺凝胶电泳可用做蛋白质纯度的鉴定，聚丙烯酰胺凝胶电泳同时具有电荷效应和分子筛效应，可以将分子大小相同而带不同数量电荷的物质分离开，并且还可以将带相同数量电荷而分子大小不同的物质分离开。
SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳可测定蛋白质分子量，其原理是带大量电荷的SDS结合到蛋白质分子上克服了蛋白质分子原有电荷的影响而得到恒定的荷质比。
聚丙烯酰胺凝胶电泳可用于蛋白质定量，电泳后的凝胶经凝胶扫描仪扫描，从而给出定量的结果，凝胶扫描仪主要用于对样品单向电泳后的区带和双向电泳后的斑点进行扫描。
电泳现象的概念是处于物质表面的那些原子、分子或离子跟处于物质内部的原子、分子或离子不一样。
处于物质表面的原子、分子或离子只受到旁侧和底下其他粒子的吸引。
因此物质表面的粒子有剩余的吸附力，使物质的表面产生了吸附作用。
当物质细分到胶粒大小时，暴露在周围介质中的表面积十分巨大。
所以在胶体分散系中，胶粒往往能从介质中吸附离子，使分散的胶粒带上电荷。
电场作用下,带电颗粒向着与其电性相反的电极移动，称为电泳。
实用的有阳极电泳和阴极电泳等。
电泳是电泳涂料在阴阳两极，施加于电压作用下，带电荷的涂料离子移动到阴极，并与阴极表面所产生的碱性物质作用形成不溶解物，沉积于工件表面。
它包括四个过程：电泳、电解、电渗、电沉积。