1.培养方式不同从2014年起，所有纳入国家招生计划的新入学研究生实行自费，同时辅以合理的奖助金。
会计专业硕士主要以自费培养模式为主，设有部分奖学金。
2.课程设置不同会计学硕士更多偏重于基础教育、素质教育和专业教育，偏重理论知识的掌握和学习，如财务理论、会计理论、审计理论、国际会计等会计相关知识。
会计硕士更多偏重于实务，学习的目的是为了解决实际工作中的问题。
3.培养模式不同主要以理论教学为主，学制一般为三年。
主要以案例式教学、研讨式教学、强调团队合作、注重培养创业型、职业化素质，学制一般为两年。
会计学硕士和会计专业硕士两者各有千秋；会计学硕士是国家基于培养面向会计职业的应用型，高层次，高素质会计专门人才的需要而新设立的一种学位类型，与会计学学术性学位相比，更侧重实际能力的培养，更突出会计职业实务工作的要求，更注重学术性与职业性的紧密结合，更强调系统掌握现代会计学，审计学，财务管理以及相关领域的知识和技能，对会计实务有充分的了解，具有很强的解决实际问题的能力，会计硕士专业学位教育面向会计职业，培养较好掌握马克思主义基本原理，邓小平理论和三个代表重要思想，坚持四项基本原则，德智体全面发展，具备良好的职业道德和法纪观念，系统掌握现代会计学，审计学，财务管理以及相关领域的知识和技能，对会计实务有充分的了解，具有很强的解决实际问题能力的高层次，高素质，应用型的会计专门人才。
会计学硕士考试科目为：学硕的考试科目：101思想政治理论、201英语一、303数学三和1门专业课。
管理学通常是因学校不同而考试科目可能不同。
专硕的考试科目：204英语二和199管理类联考综合能力，199管理类联考综合能力包括数学75分，逻辑60分，写作65分。
专业和思想政治理论在复试中进行考核。