珠江三角洲基塘农业面积减少的原因主要有以下几点：1、由于珠三角经济的快速发展，城市化的不断扩张，导致农田和水塘的锐减是基塘农业减少的一大原因。

2、由于基塘农业投入较大，收益较少，这使得农民放弃了基塘模式。

3、国家政策扶持力度不大。

4、资金技术问题，基塘农业投入成本高，且技术要求较高。