火影忍者鹿丸和手鞠同时出现的集数一共有13集，具体集数与当集主题如下：

1.第64集《云彩真是好啊》；

2.第124集《野兽暴走，所向无敌》；

3.第125集《木叶同盟国，砂之忍者》；

4.第135集《没有遵守的约定》；

5.第142集《监禁机关的三恶人》；

6.第216集、第217集、第218集、第219集、第220集《木叶增援砂隐与匠之国忍者对战》；

7.第222集《晓，始动》；

8.第227集《疾走吧勘九郎》；

9.第295集《老僧的祈祷》。